من أجل تناول القضايا والتحديات التي تواجه منطقة الشرق أطلق مركز الشرق للأبحاث الاستراتيجية ثلاثة برامج، وهم الترتيبات الأمنية الجديدة في منطقة الشرق الأوسط وشمال أفريقيا، وبرنامج الشرق حول الإسلام السياسي، ومجموعة عمل حول التحولات في المجتمع الفلسطيني ما بعد اوسلو. يهدف مركز الشرق للأبحاث الاستراتيجية من خلال الجمع بين الخبراء والأكاديميين وصناع القرار السياسي والباحثين من مختلف المجالات إلى زيادة مستوى الفهم وجودة صناعة القرار السياسي المتعلق بمنطقة الشرق. كما أنه يسعى إلى التعامل مع القضايا من منظور إقليمي ويأمل في تقديم حلول عملية للمشاكل الأكثر إلحاحاً. تقدم هاتين المبادرتين نتائجهما في عدة أشكال بدءاً من ملخصات الخبراء والأوراق البحثية إلى تسجيلات الفيديو ومخططات المعلومات البيانية (الانفوجرافيك).